基础医学学科包括了人体解剖与组织胚胎学、免疫学、病原生物学、病理学与病理生理学等4个二级学科26个研究方向，其中病原生物学和人体解剖与组织胚胎学是广西重点学科。本学科利用地域资源优势，针对桂西地区少数民族人群，开展广西世居少数民族人类学、右江流域壮瑶医药基础与应用、肿瘤分子病理学、桂西高发病免疫机制和环境因素对人体机能影响的病理生理学等研究，形成了富有特色的研究方向。
本学科现有教授20人、副教授39人，博士15人，全国优秀教师2人、八桂名师1人、自治区优秀教师4人。有硕士研究生导师26人，有国家中医药管理局三级实验室1个、广西高校重点实验室2个、桂西少数民族人类学研究实验中心和民族医药与分子生物学教学科研实验中心各1个、广西高校实验教学示范中心3个及多个科研实验室。
本学科近5年承担研究课题211项，其中国家自然科学基金19项、省部级课题70项；发表论文539篇，其中SCI收录15篇，EI收录1篇；出版专著13部、教材18部；获国家发明专利2项；获科技及教学成果奖32项，其中包括广西自然科学奖二等奖在内的省部级成果奖8项。
